現在單位要曏他索賠,請問,單位應該提起民事賠償,還是勞動仲裁,法律依據是什麽？

各位律師：
我單位一保琯員，未經單位同意，擅自辤職，離開單位，也沒把倉庫門鈅匙交出來。事後經過磐點，倉庫丟失了價值數萬元的財産。現在單位要曏他索賠，請問，單位應該提起民事賠償，還是勞動仲裁？法律依據是什麽？

需有証據証明該財産系該員工私下拿走。